另一方面，哈什院长在命令联邦士兵收复萧孟2号，特殊的异虫主巢之后。 为了减轻自己在这一连串事情中的责任，掩盖事实，他开始了自己的计划。 哈什院长利用自己目前最高指挥官的权限，下达命令。 他告诉士兵，战舰中混入了其他国家的间谍，这次的混乱就是因为这名间谍的缘故。 为了揪出这名间谍，哈什院长声称要对巡航舰上的所有人进行审查。 但实际上，他是在清除飞船上人员关于这次事件的记忆，想要将事实掩盖下去。 至于事后，无论是将罪责扣在莫须有的间谍身上还是已经死去的人身上都有选择的余地。 甚至，直接带着这一艘承载这联邦最高科技的巡航舰投靠其他势力也不失为一个选择。 哈什院长并不知道，因为他的私心，为巡航舰上的祸患争取了多少的时间。 毕竟哈什院长是目前权限最高的人，而联邦一贯森严的等级制度也为他的操作提供了便利。 但即便所有人都很配合，要将数千人都进行记忆清除依旧是一个庞大的工程。 所以借着审查的名义，哈什院长先是对士兵和研究人员进行调查、催眠、问话等一系列清查。 在这个基础上，所有主观或客观言辞中带着不利要素的人都会清除记忆。 当哈什院长接到布里索少尉的报告时，他才知道还有一些士兵，因为驻守的是很关键的位置所以最初并没有行动， 比如巡航舰出入口位置，还有动力室位置。 为了防止有漏网之鱼逃脱，哈什院长直接下令摧毁了那些作为备用的逃生舱和运输船。 并且命令已经经过处理的士兵与折跃驱动室、聚变反应堆等驻防的联邦士兵进行换防。 ……… 此刻真理号太空巡航舰上， A区：舰桥、军械库、外加一些关押重要实验体区域。 哈什院长外加一众联邦联邦士兵主要位于这个区域。 B区：各种实验室大量分散分布在这个区域。 此刻主要被萧孟所占据，新生的孵化所隐藏在其中。 C区：巡航舰的中心位置，也是各种飞船出入口的主要区域，与其他区域相通，本由布里索小队驻守。 D区：船员设施所在地，变异感染者、从实验容器中逃脱的野生异虫、加上一些幸存的研究人员在其中活动着。 E区：折跃驱动室、聚变反应堆等重要设施，由联邦士兵驻守。 ……… 经过一周多的筛选，一部分有威胁的士兵或是不愿意配合的军官都被哈什院长暗中处理掉了。 经历了此前的混乱事件，有人出现意外，导致失忆或是人口失踪并不是什么太过不可思议的事情。 将已经经过彻底清洗，完全听从哈什院长命令的联邦战士被派遣出去。 一部分与驻守在E区的联邦士兵进行替换。 而另一部分，哈什院长准备让他们开始“清扫”巡航舰上的各个区域。 毫无疑问，之前汇报中出现在D区的变异感染者群体自然成为了首要的目标。 接近千人的联邦士兵开始前往D区域，准备逐一清理盘踞在其中的非人生物。 玛西亚等人提前接到了侦查人员的报告，大家都知道了联邦士兵正在开赴而来。 变异感染者营地中，此刻展开了激烈的讨论。 “我觉得我们应该主动投降，我们还有研究价值，只要我们愿意投降，他们终究还是会留我们一命的。”
一名懦弱的变异感染者说道。 “然后呢？在实验的折磨中去死？！”
“那怎么办，好死不如赖活着，活着才有希望。”
“希望？你这样从来不敢去战斗的人，也好意思谈希望？！”
……… 现场顿时一片混乱起来，几名吵得激烈的家伙甚至差点当场打起来。 “安静！安静！我已经有了决定，我一定会给大家一个满意的答复的，都去准备一下吧。”
玛西亚脸色疲惫得说道。 ……… 众人各怀心思，离开了这个房间。 此刻还有些许战意的人，都站到了格尔曼那一方，他们宁愿死也不想再被各种实验折磨了。 然而很可悲的是，即便到了如今这个地步，还是有不少人主张避战、甚至投降。 玛西亚并没有说什么，她准备利用那些人质来为这些可悲的人做最后的争取。 然后就与格尔曼他们一起战斗到最后，她累了，也倦了……… 玛西亚命令做好准备，随时将房间中的研究员人质押解出来。 然而在这个关键的时期，作为领导者的玛西亚，她的一举一动都会被人们看在眼中，并且加以解读。 某些人自认为洞悉了她的决断。 毫不意外的，主张投降的变异感染者派遣代表主动接触，投降了前来的联邦士兵。 准备清扫D区的联邦战士因此获悉了变异感染者的详细情报。 事情很快汇报到了哈什院长那里，他对于这个变异感染者群体，特别是其中起到关键作用的玛西亚充满了兴趣。 但与此同时，作为这次混乱的主要因素之一，哈什院长实际上对变异感染者充满了敌意。 于是哈什院长下达了最新指令： “第一目标，活捉变异感染者玛西亚。”
“第二目标，杀死所有敢于反抗的变异感染者。”
“第三目标，尽量救出人质。”