自此，战争进入第二个大环节。 自2540年起，到2558年，战争已经持续了整整十八年。 在早期时，人类曾严格执行隔离措施。 但从2542年后，政策改变了。 虽然在量子网络辅助下的太空生活本就具备相当程度的社交疏离性，大部分人对病菌总会有习惯性的恐惧，尽可能的主动减少了社交，但如此这般整整持续了十余年，十余年的时间还是太长了。 在这漫长的十余年岁月里，ZS菌悄然潜伏并扩散终究从未停止。 时至今日，中招人数已然高到覆水难收的程度，至少超过三分之一总人口。 依靠强大的量子智慧，可以快速追根溯源明确的检索到感染者。 最高智脑繁星只用了不足零点一秒，就准确定位了每一个疑似感染者，并将其通知到每个人的智能辅助腕表中。 但已经迟了，这没有意义了。 Z菌的阴险狠辣自不必多言，ZS菌更丧心病狂。 潜伏、渗透、强化渗透，再到2558年7月的大爆发，一气呵成。 这是人类很熟悉的套路，但生效的对象却从动物变成了自己，造成的威胁等级截然不同。 ZS人类完全保留了其原有的记忆，也具备人类的智商，甚至连性格也不会有太大变化，但他们思考问题时切入的角度却变了。 无论他们任何一个角度去做出决策，最终的落脚处都从维护人类的存续变成了将人类从太阳系内抹除。 一线战士几乎全军覆没，遭到完全同化，三观被篡改，思维被控制。 其他各大领域，尤其是科学领域的中高层同样损失惨重。 至此，人类在技术上的优势荡然无存，战争走向彻底一边倒向了控制细菌的敌对一方。 接下来的史料，陈锋一页一页慢慢的“翻”了下去。 尽管只是用意念向小薇下达命令，让她翻页与切换视频，但陈锋却依然有种用尽全力的感觉。 他在之前谢尔盖的投影口述中已经知道了梗概，已然脑补了很多悲壮的情节。 他以为自己已经做好了心理准备，早就应该在不断灭亡中情绪麻木。 但现在他真仔细的看一遍，才发现，尽管自己已然参加了无数次灭亡战争，但脑补其实很苍白无力，真看到时，依然会心痛。 节节败退，直至灭亡。 短短八个字，可以总结从2558年至2589年的全部历史。 但在这过程中，却充斥着无数有血有肉的细节。 败退一共分为很多个阶段。 第一阶段发生在ZS人类撕下伪装，将屠刀恢向曾经的同胞，繁星给出感染人群判定结果的瞬间。 所有曾与ZS人类发生过接触，已被繁星列入感染者名单，但体内ZS菌繁殖尚未达到足够规模，还能保持独立思维的人，瞬间面临同一个抉择。 死或生？ 大部分人的选择和命令谢尔盖击毙自己的欧梦峰一样。 只不过做决策的速度稍微有点区别。 决绝的便如欧梦峰，收到消息的第一时间便先通过私人关系咨询了赖闻明。 当时欧梦峰问赖闻明，“小赖，有治疗这种细菌的方法吗？”
赖闻明：“暂时还没有。”
“大约要多久能开发出来？”
“不知道。”
“你已经研究控制细菌很多年了吧？”
“是的，从2540年一直到现在，从未懈怠。”
“那么你估计我们还能保持多久的清醒？”
赖闻明：“我不知道。控制菌不同以往。它有智慧，它可以一直潜伏在人体内十几年毫无动静，但也可能主动提高活性，快速繁殖并规模化。所以，你们随时可能被接管思维。”
“我们可以采用摧毁身体再重建的方式恢复吗？”
“不能，控制菌主要附着的位置，其实就是我们的大脑，它以一种前所未有的方式与我们的神经元细胞深度结合了。大脑无法重建。”
欧梦峰痛苦点头，老泪纵横。 良久后，他先对赖闻明说道，“对不起啊小赖，我该支持你的。”
赖闻明：“没事，欧老师，您有您的看法。”
二人挂断电话，欧梦峰将高能物理研究院所有感染者叫到了广场处，然后对着前方十余米开外，手拿蒸发粒子枪，手足无措的谢尔盖与众多安保人员大声说道：“从今日起，谢尔盖你就是高能物理研究院的院长！谢尔盖你的天赋前所未有，你可以成为继往开来的集大成者！我对你寄予厚望。我相信我们的死亡不会是结束，你可以，也必须继续走下去！开枪！杀了我们！别犹豫，开枪！”
嘭嘭嘭！ 还有一部分人在犹豫痛苦中挣扎了两三天，并在看到ZS人类的凶狠残暴，以及越来越多被标记为感染者的人突然失控后，这些犹豫不定者崩溃了，陆续做出决定。 有人走出了空间站里的空间，浮尸于宇宙中。 有人跳进了夸克分解机。 有人驾驶着飞船撞进了太阳。 还有人手拿高爆炸弹，在量子网络中与家人告别，再轰然引爆。 …… 第一阶段，被谢尔盖命名为“告别”。 第二阶段则是“抉择”。 为了弥补大量银河战士背叛带来的战力缺失，初出茅庐的年轻谢尔盖跨越了数个学术等级，和赖闻明联手成立了基因快速突破计划。 突破计划的本质与殖装战神和魔战稍有区别，只吸收了部分陈锋留下的Z菌和殖装魔战的体系，再辅之以赖闻明等生物学巨擘重新衍生的知识，选择了更重人类自身潜力发掘，而不是变成其他物种的非魔战思路。 只用了三天，突破计划完成，大约两千万人在不同的空间站接受了改造，幸存人数为四百万人。 这四百万幸存者的唤醒度快速突破35%，披挂上了由谢尔盖改良了智能算法的全新银河战甲奔赴战场。 第三阶段，则是“胶着”。 在这个阶段里，人类和ZS菌的战争从太空打到了地面。 人类曾短暂的夺回过地球，但由于在地球上需要保持超高等级的防护措施，行动十分不便，人类又离开地球。 在整个交锋的过程中，虽然ZS人类初期掌握的生产力不如人类，主要作战单位仅仅是原银河战士的ZS人类，以及海量的异化动物。 但异化动物的繁殖能力实在过于惊人，太阳系内的所有行星都是兵源。 这些茫茫多，且极难完全灭杀的兵源弥补了ZS人类前期的兵力劣势。 发生在太空站、战舰上的争锋也大为削减了人类的军事实力。 虽然人类反应很快，但ZS人类的潜伏行动呈群聚性，在总人口三分之一感染的基数上，人类却有高达五分之二比例的舰船整体叛离。 各大太空站也受创严重。 人类大约夺回了三分之二太空站的控制权，另有六分之一的太空站遭到了毁灭性的破坏，还有六分之一太空站则是人类被清除后，剩余的ZS人类整体叛变。 另外，还有多达数亿艘小型飞行器私自起飞，在太空站上一通大肆破坏，然后扬长而去。 这种种变故，让ZS人类顺利度过了前期。 自此，战争进入第四阶段，“无力”。 随着ZS菌异化动物的快速繁殖与进化，建立在巨型变异海生动物基础上的生物太空舰出现了。 一些大型鸟类与缝合类异化动物，则又长成了各种ZS人类的单兵装备，以及各种组合式战争机械。 陈锋求而不得的种植战舰技术，ZS菌仿佛天生就会，只是需要一些年的沉淀，以及消化吸收人类的成果而已。 此后，人类的太空优势顷刻间荡然无存。 在这个阶段的对抗中，人类感受到了深深的无力感。 无论人类如何不知疲倦的拼搏，都比不过ZS菌的再生能力。 无论谢尔盖等人如何快速改良装备，ZS菌的兵力在经历过短暂的慌乱后，总能快速稳住局面，并反过来吸收人类的新技术。 ZS人类在战术战略上也表现出了极高素养。 在正面战场上，ZS人类的舰队可以与有繁星操控的人类兵力比拼精微控制能力。 在小型战场上，ZS人类更是奇招迭出，且个个悍不畏死，战斗风格突出一个兑子流。 随着战争进程的深入，在另一个战场中，赖闻明与谢尔盖等人却也从未停止过钻研。 当时赖闻明与谢尔盖两人的分工十分明确。 谢尔盖负责改良人类战争武器的性能，赖闻明则既负责尝试研发控制菌疫苗，可能治愈控制菌感染的特效药，以及各种战场快速治疗、提高能力的注射药剂。 赖闻明的工作量既大又难，后面两项还好，虽然艰难，但总能时不时看到进展。 唯独前面两项，当真是既折磨他的身体，又折磨他的精神。 那种无论再怎么努力都两手空空一无所获的感觉，实在太痛苦。 赖闻明在最绝望时，与谢尔盖私下会晤时曾抱头痛哭，一边哭一边咆哮。 “为什么宇宙中可以有这种生物？凭什么？这不公平！能够制造这种生物的敌人，凭什么要与我们为敌？我们根本连给他们造成一丁点伤害的能力都没有。我们与他们的差距比蚂蚁和巨象还要大无数倍。这是为什么！”
赖闻明瞪着一双浑浊老眼，抓住谢尔盖的肩膀一直问。 谢尔盖想了很久，“大约，因为我们是人类吧。先哲陈锋一定也思考过这个问题，但我想，他肯定从未有过迷惘。他只是接受了这个命运，然后一点一点的，尝试着往前走，仅此而已。”
2589年，人类最高科研空间站坠落在澳洲大平原的中部。 人类败亡，ZS菌化作烟花在太空中消散，太阳穹顶消失。 属于第九条时间线里太阳系人类文明的历史，到这里戛然而止。 陈锋默默合上书卷。 他狠狠给了自己一巴掌。 这次的人类其实曾经有机会避免悲剧，但做很多错误的决定。 陈锋也知道错在了哪里。 但归根结底，错全在他一人。 他本来以为自己早已做好了心理准备，可以承受亲手缔造的太阳系末世。 可遗憾感、失落感与愧疚感总也挥之不去。 他仰头望着阅览室的天花板，呢喃自语。 “对不起啊，各位。下次我会做得更好。一定。”
天花板之上，那些阵亡在二十六世纪的英灵们仿佛依然漂浮着，静静的看着他，在另一条时间线中等待着他。 当然，也许已经没有下次了。 这次出去了那么多人，猎户臂里早已建成无数个殖民地。 所以陈锋认为，人类有一定的机会取胜。 他也这般希望着。 但他依然要观察，要抉择。 理智告诉他，但凡是有亿分之一的可能，他依然会去争取。 但如此一来，或许时间线就此收束，消失了的太阳系文明直系后裔再也回不来了。 或许很可能包括孩子妈。 他有这个焦虑。 可他不能为了一群人，去放弃另一群人。 陈锋很想念孩子妈，当然也舍不得孩子妈。 可他又知道，如果让孩子妈知晓他为了她而放弃了一个自由的宇宙。 以她的性格，一定不会原谅我吧？ 她可是最喜欢牺牲她自己的人呢。 所以，陈锋告诉自己，我依然会去争取一切可能，但我也会坦然面对失败。