第一兵团之中建立了一个部队，收纳这些太监等。至于原本的一些宫女，则让国防軍受伤士兵从中进行挑选，两厢情愿之下，便结合为一对。也算是为国防軍受伤推移士兵，安置了一个家。清理完皇宫之后，秦牧吩咐政治部主任史恒专门从国防軍之中挑选了一部分士兵，进驻到了皇宫之中，负责皇宫乃至整个应天城的驻防工作。而何奇、彭峰等人也把这一战的战果汇总了上来。应天城一战，总共歼敌两万六千余人，另外俘获敌军士兵五万七千余人。整个耿仲明所部已经彻彻底底的被全歼了，而这个时空中耿仲明也彻底成为了历史名词了。成果卓著，而国防軍所部的伤亡也高达三千余人，其中大部分都是受轻伤的，战死的非常少。如此巨大的成就，也让秦牧有些欣喜。收复应天城的消息，也很快就传到了江阴那边。原本等候在江阴等地的皇帝朱常淓等人，也在五月十五日，乘坐沙船溯江而上。在五月十六日，抵达了江边码头。浩浩荡荡的队伍，抵达应天城之后，在教导旅的护卫之下，皇帝朱常淓以及内阁成员，进入到了皇宫之中。现如今的皇宫，不单单是皇帝朱常淓的住所，也成为了内阁等人的驻地。虽然现如今的皇宫已经大变样了，但是收复应天城，还是让皇帝朱常淓等人，时分欣喜。毕竟自从弘光皇帝丢失应天城之后，朱常淓一直游荡在江南诸地。现如今收复太祖皇帝定鼎之地，还是让他们十分高兴。五月十八日，良辰吉日。在内阁诸人的攒拥之下，皇帝朱常淓举行了还都仪式。并且事先通知秦牧等一干在应天城的国防軍高层将领参加仪式。对于这个消息，秦牧倒是没有反对。在五月十八日当天上午，位于应天城皇宫之中，军乐齐奏，一片喜气洋洋之中，内阁诸人领衔，六部尚书侍郎、都察院都御史、佥都御史，以及六科等部官员，并排矗立在殿前广场一边。而另一边，则空荡荡的。一直到上午八点，广场内国防軍士兵忽然站得挺直。听到轻微声响的诸位官员回头看去，只见秦牧当先，率领着江北总督卫胤文、政治部主任史恒、江南总督任民育、情报处处长杨锦添、步兵第一师师长马应魁，以及各团营长何奇、何刚、彭峰、乔洋、庄子固、罗胖子、宋秋明、魏和尚、吴尔壎、蔡庆忠、张论平、何春见、余林峰、罗兆明等人，昂首挺胸，迈步走了进来。这些人全部一身国防軍軍服在身，就连卫胤文和任民育，以及江南江北一些府县的主官等人，全都是一袭与国防軍軍服有些相像的服装，看上去整整齐齐。吉时到了之后，皇帝朱常淓穿着衮服走上高台。一侧的内阁文官，全部扑倒在地行叩首大礼。但是这一边的秦牧等人，却只是冲着高台上行了一个军礼。就连卫胤文、任民育等人，俱是如此。对于这一幕，内阁大学士黄道周愣了愣神，心中却无奈地叹息一声，不再多说什么。就连皇帝朱常淓也不好多说什么，他只是摆了摆手，平淡地说道：“众卿免礼。”
还都仪式并没有举行太长时间，仪式上皇帝朱常淓为了表示对国防軍的感谢，赏赐给国防軍诸位将领、师团营长各类的爵位以及金银珠宝等等。不过对于这些，没有一名师团营长敢开口说话，都没有令下这份赏赐。因为他们都知道，站在他们前面的乃是国防軍軍事委员会委员长秦牧！许久，秦牧发话了，“既然陛下如此有心，诸位就接受吧。”
秦牧话音落下，诸位国防軍将士才领命。如此威严，众人哗然。