五年后
灭绝师太见纪晓芙已经能够打理好峨眉派，并且得到了峨眉众弟子的拥护。
所以，灭绝师太决定联系六大门派，围攻光明顶。
灭绝师太之所以想要围攻光明顶，杀了明教中人，是因为自己的哥哥与自己的师兄，都被明教中人给害死了。
灭绝师太的哥哥喜爱种田读书，从不与人交往，谁曾想被金毛狮王谢逊杀害。
而灭绝师太的师兄，孤鸿子也因与明教的光明左使杨逍比武落败，被杨逍抢走倚天剑负气而死。
因此灭绝师太性情大变，对明教的仇恨越加深厚，现在变成了只要是明教中人，灭绝师太都想要杀了他。
只不过明教中人虽然都被武林正派称为魔教，但实际上明教也有很多人，在大宋与元庭的边界，为保护大宋百姓而战。
灭绝师太知道纪晓芙在峨眉的话，一定会阻止自己，所以便将纪晓芙派去联合抗元队伍，跟纪晓芙一起去的还有蛛儿。
灭绝师太知道，等六大门派围攻光明顶时，白眉鹰王殷天正，与殷野王也会去，所以便把蛛儿也一起支走。
而灭绝师太则亲自联系了六大门派，准备围攻光明顶。
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武当派
张无忌发现宋青书喜欢上了周芷若，便怂恿宋青书去向周芷若告白，之后还将此事告诉了武当掌门宋远桥。
结果知道了六大门派即将围攻光明顶，张无忌找到张真人，希望张真人允许他一起前去光明顶，张真人见张无忌的恳求他，便同意张无忌一起前去。
在去光明顶的路上，张无忌发现了元人的踪迹，便将此事告诉了武当派众人。
之后与五大门派的人说明有元人埋伏，想要将六大门派与明教一网打尽。
当然也有人说是明教与元庭的合谋，结果被灭绝师太反驳，六大门派的人都知道灭绝师太与明教的恩怨，所以对灭绝师太的话深信不疑。
最后众人商量，先与明教休战，将元庭之人杀了。
等纪晓芙知道后，明教教主已经是张无忌了，按理说他是武当弟子，不能成为明教教主。
但他除了是武当弟子以外，也是白眉鹰王殷天正的外孙，是金毛狮王谢逊的义子。
而且，张无忌在光明顶山下，还看到了杀害谢逊一家的凶手成昆，并将成昆交给了明教中人。
六大门派假装围攻光明顶，将埋伏的元人全部抓获后，灭绝师太挑战杨逍，将杨逍打败，虽没杀了杨逍，可也出了一囗恶气。
之后六大门派与明教一起对抗元庭，在此之间，武当派宋青书娶了峨眉派周芷若。
张无忌娶了一名名叫小昭的女子，而小昭便是明教四大法王，紫衫龙王黛绮丝的女儿。
这一世纪晓芙没有跟杨逍在一起，虽然没了一个女儿，但纪晓芙这辈子有了蛛儿这个徒弟。
而谁也没有想到的是，纪晓芙的宝贝徒弟殷离嫁给了朱元璋的手下，也与自己的父亲和解了。
纪晓芙在知道殷离的选择后，便同意了殷离的婚事。
之后，张无忌带着自己的妻子去冰火岛，寻找自己的义父金毛狮王谢逊，而纪晓芙知道后，便和张无忌一起去了。
而他们在冰火岛没有找到金毛狮王谢逊，反而在离冰火岛不远的一处小岛找到了金毛狮王谢逊。
与此同时，还见到了金花婆婆黛绮丝，纪晓芙与金毛狮王谢逊见面后，便将倚天剑与屠龙刀的秘密告诉了谢逊。
然后两人刀剑相击，取出了九阴真经，降龙十八掌和武穆遗书。
纪晓芙与谢逊商量，等回到中原，将降龙十八掌交还给丐帮帮主，武穆遗书则交给朱元璋。
之后因小昭的缘故，纪晓芙帮助张无忌打败了西域特使。
而张无忌想带着小昭，和谢逊一起在冰火岛生活，可是谢逊知道成昆已死，自己当年伤害了太多人，所以便要求张无忌带他一起回到中原，给武林中人一个交代。
之后一行几人又乘船回到中原。