小智三人组到紫苑镇了。
“你在干什么？”刚到紫苑镇的小智看到一个怪人正在对墓碑做些事情。
“我在挖墓。”怪人回答道。
“为啥，你真的很怪。”小智很不理解。
“我是个有需求的单身汉。”怪人说道。
“...”小智无语了。
“老妈，你怎么会在这里？”小智见到了自己的妈妈。
“小智，你来紫苑镇了，我陪你梅拉阿姨过来的，今天是你皮特叔叔的忌日。”小智的妈妈花子解释道。
“小新的爸爸吗？”小智问道。
“是的，在上一次宝可梦大战争中受伤去世了。”花子说道。
小智陪他妈妈聊了，好一会才分开。
而小刚跟小霞被这么一片墓碑吸引住了，跟墓边的老爷爷聊了起来，老爷爷看他们挺感兴趣的，就跟他们说了这里的一些事情。
“很久以前，远在你我出生之前，这个地区曾经是一座古城，突然，一夜之间，整个城市被毁，过了一段时间，这片区域才被改建成墓地。”
“是什么摧毁这个城市？”
“无人知晓。”
“石头上这些怪字是什么？”
“许多年来，历史学家一直试图破译这些文字，到至今没有一人能破译成功。”
突然下起了大雨，小智三人组赶紧跑到宝可梦中心去避雨。
“乔伊小姐，我们能进来避会雨吗？”门被锁了，小智问道。
“不行。”乔伊小姐回答道。
“什么？”小智不敢相信。
“这里是宝可梦中心，要么治疗你的宝可梦，要么滚开。”乔伊小姐生气说道。
小智一行人无语了，只好撑着伞去别的地方。
“抱歉，打扰了，请问我们可以在这里呆到雨停吗？”小霞问道，眼前的老人看起来比紫苑镇的其他人们和善多了。
“当然可以。”富士老人很大方收留了他们，还给他们一人准备一碗面汤。
“谢谢您，好心的老爷爷，我们很感激您允许我们住下来，镇上的其他人都非常粗鲁。”小智三人吃着美味的汤面。
富士老人开口说话了，“这里的人们成了自己恐惧的奴隶。”
“你们可以叫我富士老人，多年来，这个小镇都是死去的宝可梦的聚集地，为了祭奠它们的灵魂，给它们一个安息的地方，紫苑镇的人们建立起了宝可梦塔。”
“最近那座塔出现了幽灵，没人敢靠近。”富士老人继续说道。
“哈哈哈哈，幽灵，您说，幽灵。”小智吃一半忍不住笑出来了，在他的理解里，这世界哪有什么幽灵，最多就是一些幽灵系的宝可梦。
“你们亲眼见到了镇民们的恐惧，他们变得如此害怕鬼魂，以至于忘记了如何相互信任，他们甚至不会跟陌生人进行交流。”富士老人说道。
“幽灵是真的吗？哈哈哈。”小智还是不太相信。
“你说的话就像我见过的另一个叫小茂的小伙子。”富士老人说道。
“小茂？小茂。”小智心想，小茂已经来过这里了。
“是的，他是我劲敌，他现在在哪里？”在小智心里，从小跟他对着干的小茂是最好的对手，小新是他的邻居，他的好朋友。
“早些时候，他还在这个镇，就像你一样，当我告诉他，宝可梦塔有幽灵时，他一笑置之，然后他跑到宝可梦塔，他以为他会证明我错了，但过去两周了，他都没有回来。”富士老人担心说道。
虽然小茂比较高傲，又有些倔脾气，但他可是很厉害的训练家，自己遇到他三回了，每次都输给他，是什么让他整整两个星期没有回来，难道那座塔真的有幽灵，小智想去调查清楚。
“小刚，小霞，你们要不要跟我一块去宝可梦塔调查调查。”小智初生牛犊不怕虎。
“不了，我有点怕。”小霞说道。
“我跟你去吧，我也不相信，科学世界有幽灵存在。”小刚说道。
“那，那我也去吧。”听小刚这么说了，小霞也勇敢了一些。
于是三人等到雨停的时候，去了宝可梦塔。
小智三人走进到宝可梦塔，第一层还好，到了第二层的时候，就立刻起雾了。
“一只可达鸭，一只可达鸭在那里做什么，？”小霞发出了疑问。
“什么鬼？”小刚被吓了一跳，可达鸭是只尸体。
“雷丘，十万伏特。”小智的雷丘使用了十万伏特，可达鸭的尸体不再动了，腐烂了。
接着又跑来一只呆呆兽的尸体，向小智他们攻击过来，也是被雷丘一招十万伏特电腐烂了。
“都腐烂了，应该是尸体被什么控制了。”小刚说道。
第二层的迷雾消失了，小智心想，一定是迷雾控制了这层宝可梦的尸体。
来到第三层，还是迷雾弥漫，小智三人，遇到了训练家。
训练家嘴里喊着，“求你们带我出去，这里有坏东西在控制尸体跟我们，啊啊。。。啊啊啊啊啊啊啊！！”
说完，训练家派出宝可梦跟小智对战，小智派出喷火龙跟雷丘轻松打败他的宝可梦后。
“小智，你看，这是一块金色的墓碑，雾就是从这里传出来的。”小霞发现了一块金色的墓碑。
三人靠近墓碑，墓碑里出来一只鬼斯。
“是你制造了这些迷雾。”
“鬼斯，鬼斯。”鬼斯向小智三人攻击来。
雷丘及时的十万伏特打跑了鬼斯，鬼斯一跑，迷雾就消失了，那个被控制的训练家，高兴大叫:“我自由了，我从幽灵手中逃出来了。”
说完他就赶紧下楼，逃出了宝可梦塔。
小智三人相视一笑，原来真是幽灵系宝可梦在搞鬼，竟然不是真的幽灵，那就没什么可怕的了。
三人继续上楼，来到第四层。
跟第三层一样，一样是迷雾弥漫，一样是有训练家被控制，不过他们都不是很强，小智的雷丘跟喷火龙很简单就打赢了他们。
还是有一块金色墓碑，三人靠近时，这次是一只鬼斯通。
鬼斯通比刚才的鬼斯厉害，不过还是被雷丘跟喷火龙联手打败了。
这只鬼斯通没有跑，小智就丢出精灵球把它给收服了，小智之前在枯叶市的时候就把大钳蟹送了回去，他身上有空余的位置。（雷丘，喷火龙，杰尼龟，巴大蝴，比比鸟）
小智收服了鬼斯通后，迷雾消散，被控制的两名训练家恢复了正常，也逃了出去。
看起来事情并没有那么复杂，只是有几只有幽灵系宝可梦控制了这座塔。
三人继续上楼，来到第五层，还是一样的情况，这回金色的墓碑只是个小鬼斯，小智还没有打，它就跑了，迷雾消散。
小智三人来到第六层，刚到第六层，就有一道威力巨大的水炮打了过来，小智的喷火龙被命中了，受到巨大的伤害。
“小茂，你，你也被控制了？”小智看到小茂带着水箭龟向他们走来，刚才的水炮明显是水箭龟发射的。
“小智，拿出宝可梦打败他，他明显被控制了。”小刚在一旁说道。