在度假胜地蓝普尔其休息了一晚，小泽和小智一行人再次和大木博士告别，沿着海岸线出发了。在一望无际的大海上，望着远去的轮渡。因为小智睡过头了，小泽他们错过了轮渡。
“小智，你是不是衰神附体呀”小泽嫌弃的看着小智。
“唉”小智倒是习以为常的在码头边躺下了。
小刚：“人生无常，大肠包小肠啦。”
“皮卡？皮卡丘！！”皮卡丘此时发现了什么，指着海面叫着。
“是墨海马，好可爱诶！！”小霞惊喜的说道。
小泽几人顺着皮卡丘的小爪子望去。霍～还真是一只伤痕累累的墨海马，左眼还被来了一个电炮，阙黑阙黑的。
小智顺手掏出神奇宝贝图鉴就给大家来了一波科普。
墨海马看见小智几人望着自己，马上激动起来，冲着海面就是一口墨汁，呸！
“这孩子，咋胡乱吐墨水呢。”小智嫌弃的说道。
“别说这个了，现在当务之急是给墨海马治疗，”小霞速度飞快的扔出一个宝贝球，墨海马get！
小泽：(￢_￢)我怀疑你就是担心小智跟你抢吧！
远处突然发生爆炸，把四人的注意力吸引了过去。只见一艘快艇发生爆炸，船员落水后又被某种神奇宝贝攻击陷入麻痹。小泽放出暴鲤龙把他们救了上来。
“那艘船怎么会发生爆炸呀”小智疑惑的问道。
这时一位经理走上前，“感谢你们救了我们的船员，我们社长邀请你们一趟！”
来到一间豪华的房间，突然冒出一个与蓝普鲁奇金婆婆一模一样的人出现，“我就是社长，婆婆！听说你们救了我的员工啊！婆婆！真是太感谢你们了，婆婆！”就连口头禅也是一样。瑙水母所为。
小智摸着头说道：“那个……请问我们是不是在蓝普鲁奇见过面！”
金婆婆突然大声说道：“你们不要把我跟那个性情古怪的人扯在一起，婆婆，我是她的表妹，婆婆！”
“表妹？”小智等人惊讶的说道。
“你找我们来什么事？”小泽说道。
“我要在这儿建设出超越蓝普鲁奇的观光度假区，婆婆！”金婆婆说道。
“就是海上那个？”小霞问道。
“这当然了，那可是最大的招牌建筑哦！超级豪华海上旅馆，天堂乐园大饭店，婆婆！王牌中的王牌就是被全世界最美丽的珊瑚礁所围绕的蜜月套房啦！婆婆！但是……那些烦死人的玛瑙水母却老是爱跑来妨碍我的工程，婆婆！”
“你们几个，既然会用小精灵来救人，婆婆，那么来帮我赶跑水母怎么样啊！我当然不会让你们白干的，成功的话！一年之内全世界最豪华的晚餐，随便你们吃到高兴，还有奖金一百万元，加上饭店的住宿卷一年份！”
还未等金婆婆继续用利益诱惑，小泽已经不屑的走了出去，叫小霞去伤害水系小精灵自然是不可能的，见同伴们都走了，小智与小刚也紧随其后。
“这时代竟然还有不要钱的小鬼！婆婆！”金婆婆气愤说道。
气愤不已的小霞正在向同伴控诉金婆婆的罪恶，突然城市的广播响起，“大家都听好了，为了赶跑我们鸠羽港的天敌玛瑙水母，现在开始募集有志于此的勇士，婆婆，为我赶跑那些水母的人，我要发给他一百万元，金婆婆我是一言九鼎啊！婆婆！想要钱的人……额，是想让本地有发展的人，赶快聚集到码头来吧！
这时，大地突然颤抖，只见众人身后一群人飞快的向码头跑来，望着一望无际的人海，小霞也惨遭打脸。
“这个世上没有金钱是不可能的，这些人也不过是为了自身的利益，没有对错！错的只是撒下欲望的幕后者！”小泽深知利益牵扯的资本链，这一幕也不过是冰山一角！
一听到有奖金，火箭队斗志昂昂主动请求出战，将国产三杯醋倒在一只即将进化的玛瑙水母身上，那只玛瑙水母产生了变异进化，活生生进化到堪比高楼的超巨大毒刺水母！
人类一直以来霸占玛瑙水母生存区域的报复终于到来了！庞大身躯的毒刺水母率领玛瑙水母对城市发动攻击，无数高楼大厦被击倒，人群也发出惨叫逃散四周，一座城市即将被海水淹没。
“破坏也得有个程度，不能让你继续下去了！”
小泽把六只神奇宝贝都派出去了，火恐龙和青藤蛇在各个废墟之上移动。
六只小精灵全力发出最强一击将毒刺水母庞大的身躯击退。海水也因为他的重量掀起不小的海浪，火恐龙释放火焰将其蒸发。
小泽打开了好久不用的系统背包从里头取出一颗高级球。高级球在联盟的价格可是一千联盟币，小泽就是靠系统签到也才有十颗。
“大家合力一起打倒这只毒刺水母。”小泽把玩着高级球说道。
六只小精灵战意昂昂，一道火焰漩涡先为这场战斗拉开序幕，断其退路；一发旋风刀和一发十万伏特持续输出。最后接上一发破坏死光和水流尾，将毒刺水母好不容易摆正的姿态再一次颠倒。
好不容易得到复仇的实力，毒刺水母怎能轻易就此罢休，一发水枪如同炮弹一样，直接将飞行的比雕打入水中，羽毛淋湿的比雕也因此速度受到严重的影响。
勒克猫使出电光一闪快速接近毒刺水母，跳起来一招雷电牙咬在毒刺水母身上。毒刺水母痛苦的发出惨声。火恐龙与比比鸟使出组合技火焰龙卷攻击，杰尼龟使用高速星星持续攻击，暴力龙使出逆鳞，双眼变红光，全身泛红光冲向毒刺水母。
一股脑的全部击中毒刺水母，就算是体力充沛的毒刺水母也被轮番的攻击打败，成功打败毒刺水母的小精灵们兴奋不已，白光从身上冒出，火恐龙与勒克猫成功进化成了喷火龙与伦琴猫，得到了飞行的能力，喷火龙也自在的畅游在天空之上。
“去吧，高级球！”小泽将手中的高级球抛出，毒刺水母化作红光吸入超重球内，或许是因为不想再被围殴，高级球甚至连挣扎的摇晃都没有，直接被小泽顺利的收服。
喷火龙见此抓起超重球想要交给小常，却不料被重新复活的火箭队用机器手拿走，愤怒的喷火龙刚想要发动攻击，神速的比
喷火龙见此抓起高级球想要交给小泽，却不料被重新复活的火箭队用机器手拿走，愤怒的喷火龙刚想要发动攻击，神速的比雕一口穿破热气球，火箭队再次化作流星飞走，从火箭队的手中拿回高级球交给小常，虽然功劳被比雕抢走，不过毕竟是自己的同伴，喷火龙可没那么记仇。
用图鉴将高级球传送回大木研究所，并为其备注先看数据再打开。
将试图阻止的金婆婆打飞，玛瑙水母群夺回了自己的领地后，也放弃了继续进攻城市的打算，一开始它们就是为了夺回自己生存的领地，没有别的坏心思。
超巨大毒刺水母事件完美结束，小泽等人也暂时一起踏上了旅行。
“哇！好巨大的毒刺水母，还好小泽给我备注了！”