再次让西安府封地的明秦景亲王：朱存机，感到危机四伏！他当即下令秦亲王府仪卫司、秦亲王府护卫指挥使司（西安右护卫）加强兵力防御。明崇祯八年公元1635年正月18日，河南承宣布政使司流寇攻陷了开封府荥阳县、汜水县、以及汝宁府固始县。农民军13家72营20多万大军，还在开封府荥阳县举行大会，推举了流寇：闯王（高迎祥）为首领，决定大军今后的去向？在由流寇：闯将（李自成）提出东征，要去破坏朝廷的风水。此举得到了流寇将领们的一致认可。以至于开封府的明周端亲王：朱肃溱，得知藩地再次被掠，病情更加严重！而明周亲王世子：朱恭枵，每日都得在床前守着，但在世子殿下的处理下，周亲王府仪卫司、周亲王府护卫指挥使司（宣武卫）得到加强。另外汝宁府封地的明崇愍亲王：朱由樻，显得非常害怕！他也下令崇亲王府仪卫司、崇亲王府群牧所（而崇亲王府护卫指挥使司（汝宁卫）因被废为汝宁守御千户所，不属于崇亲王府管辖）因此他只能加强，这两处机构防御。此时河南承宣布政使司流寇们，已发展到了数十万人马，并且各自出关，分为三部；一路自河南府陕州北上平阳府入山西承宣布政使司、一路自西安府商南县武关巡检司走襄阳府入湖广承宣布政使司、一路自河南府卢氏县东向分犯河南承宣布政使司、北直隶。而河南承宣布政使司、北直隶诸盗，又复分为三部；一部走汝州伊阳县进犯陷开封府荥阳县、汜水县，焚掠无遗东剽及郑州，一部走南阳府叶县、舞阳县，南围汝宁府上蔡县，一部由怀庆府东渡河掠夺归德府、睢州、汝州、开封府陈州、许州，等地。其中湖广承宣布政使司襄阳府的流寇，与河南承宣布政使司汝宁府流寇们，合并为十五营，人数达到十万，并入襄阳府境内劫掠。使得明襄忠亲王：朱翊铭，非常害怕！他连忙上奏朝廷，要弹劾地方驻军们防守不利罪。明兵科左给事中：常自裕，也急忙上奏称“中原天下安危所系，今群盗充斥，乃仅以左副总兵一旅战渑池县，而陈左参将等数营扼守汝州，陈总兵则孤军堵在南阳府，贼势日众兵力日分，贼有二三十万，大小七十二营，蜂屯至汝州伊阳县、开封府郑州、南阳府南阳县、西安府雒南县之间，以数千官军东西堵拒，贼何所畏而不长驱哉！乞更选边兵，统以廉勇之将，特选重臣视师，庶腹心不致决裂也。”
接着河南承宣布政使司的流寇们知道有明军围剿，就复逃回陕西承宣布政使司汉中府，攻陷宁羌州，在转入临洮府、巩昌府，一带州县劫掠。而来到南直隶的流寇们继续攻陷了凤阳行都督府霍丘县。这使得兵部急忙商议，抽调西北边军及中原南兵，共七万二千人、粮食九十三万六千石，并发库银二十万两，齐赴督臣军前，更命明五司总督兼兵部尚书：洪承畴，统率大兵出河南府潼关卫，去节制诸路巡抚、总镇总兵，合力剿贼，限期六个月内扫荡清除流寇。如仍留余孽，则总督、巡抚诸臣们当除以重典，其禁止一切听督臣概不中制，明五司总督兼兵部尚书领旨后，急忙率军赶赴河南承宣布政使司。待明五司总督一撤，陕西承宣布政使司的流寇们，立刻就攻陷了平凉府灵台县，致使明韩穆亲王：朱亶塉，只能自己写信求平凉府固原卫总镇军队抵抗流寇。而河南承宣布政使司流寇们，开始兵分三道；一路入庐州府六安州、一路入凤阳行都督府寿州、一路入凤阳行都督府颍州、蒙城县。很快南直隶凤阳行都督府颍州就陷落了，明颍州知州：尹梦鳌、明凤阳行都督府通判：赵士宽，直接斩杀妻室并自尽殉国而死。随后流寇们就来到了凤阳行都督府首府中都留守司境内，辖区的明中都留守司留守：朱国相，连忙召集了凤阳右卫、凤阳中卫、皇陵卫、凤阳卫、留守左卫、留守中卫、长淮卫、怀远卫和洪塘守御千户所兵马进行抵抗。这时中都留守司内，以明中都留守司留守：朱国相，为主，率领着明凤阳卫指挥使：袁瑞徵、明凤阳右卫指挥佥事：吕承蔭、明凤阳中卫指挥使：郭希圣、明皇陵卫指挥同知：张鹏翼、明留守左卫指挥使：周时望、明留守中卫指挥佥事：李郁、明长淮卫指挥同知：岳光祚、明怀远卫指挥使：陈弘祖、明洪塘守御千户：陈其忠、明洪塘守御千户所镇抚使：金龙化，等将领率部四千明军出战迎敌。农民军主力部队则由首领：闯王（高迎祥）、西营八大王（张献忠）、闯将（李自成）、老回回（马守应）等部率领，包围了凤阳行都督府境内各大州县卫所。击溃这股应战明军，开始杀入皇陵卫，把二万二千六百五十三间亭台、楼阁、宫殿、庙宇，等全部焚烧为灰烬，并且斩杀守陵宦官者六十人，还放出高墙内罪宗者百余人。农民军：扫地王（张一川）、太平王，等将领入〈凤阳行都督府〉内，明凤阳行都督府知府：颜容暄，急忙穿上囚服混入狱中，却不料被流寇们抓获。农民军：西营八大王（张献忠）击鼓高坐堂上，下令杖打明凤阳行都督知府将其杖毙！就连卧病在床的明凤阳行都督府推官：万文英，等六位官员，四十一位武将皆被杀害，士大夫被杀者有数万人，官员夫人有孕妇者还被剖腹，又把婴儿用「槊」刺死！流寇们还高举旗帜，写着「古元真龙皇帝」六个大字，既；蒙元之后的大宋天子，指续~小明王：韩林儿，政权统治。农民军各部首领们，合乐共饮庆贺胜利，并开始劫掠凤阳行都督府三日。明凤阳行都督府监军：卢九德、明登莱总兵：杨御蕃，以三千川军前来救凤阳行都督府，恰好与赶到的南直隶应天府南京城中军都督府卫所军相遇。而流寇们得知大批明军即将到来，就用竹席往皇陵卫里面的神祠上盖去，不想让大明先祖们看见自己的罪行（毕竟都是穷人出身！）在用瓜皮锤、破甲锤，往神像上砸去，以破坏大明龙脉之气。之后才拔营南下，沿途一路杀掠州府县卫所官兵无数，南逃入庐州府。很快明五司总督兼兵部尚书：洪承畴，与明山东总镇巡抚：朱大典，等部明军汇合，一起拦截剿贼。还在南直隶奔逃的流寇们，又攻陷了庐州府巢县、舒城县，以至于明舒城县知县：章可试，关闭三门，只开西门诱敌深入，让其陷于深坑当中斩死1千人。因而让流寇们吃亏，转而去掠夺庐州府霍山县、庐州府首府合肥县。未时，农民军们围攻六安州，破州城之后聚集干柴百梱在城内点火焚烧，听其哀号为笑乐！又把数千官员夫妇去掉衣裳，驱赶到城下集体侮辱，若有抵抗立即杀之，掠夺三日才逃走。朝廷得知南直隶有变，就让户部出内帑二十万两黄金当做剿饷、又发太仆寺十万两黄金，输送到陕西承宣布政使司西安府。其中湖广承宣布政使司出饷银十九万两，发放给重镇官兵，而各部盐课提举司出饷银十万两，送交南直隶淮安府、扬州府，等地以防流寇。正月27日，明兵部尚书兼五司总督：洪承畴，调集南北两军七万人、马一万五千匹，再让户部发给每位士兵一日三分银（约等21文钱，21个铜板）、米一升五合、马日草一束、后勤火头军一日二分银（约等14文钱，14个铜板）、豆三升、二分银总计五个月，约为十一万白银。随后明军们士气大增，火速追击流寇，迫使农民军急忙从庐州府舒城县抵达庐江县。城内的军民们见状，连忙以金银恳求流寇不要屠城，在佯装答应流寇们进城。待夜半时分，流寇们驻扎下来之后，军民们就直接袭击城内的流寇，逼得流寇们连夜逃走，前去南直隶无为州。此刻明五司总督兼兵部尚书才刚抵达河南承宣布政使司，就吓得中原境内的流寇们，又跑去河南府潼关卫境内。而明五司总督派遣了明河南府副总兵：来胤昌，以1千2百人前往陕西承宣布政使司西安府镇守，在令明重庆府总兵：秦翼明、明重庆府左参将：游来，朝官道向南直隶徐州方向出发，速去围剿江南流寇。此刻农民军：满天星（张大寿）、西营八大王（张献忠）等部，攻打安庆府桐城县不利。故此流寇们骑兵绕城下呼降，守城明将们则用弓箭、火铳，射中其满天星的腰，让他夜走安庆府潜山县、太湖县，之间。不过山中多有山贼、猎手，专射虎豹，且药弩窝弓都设有，听闻流寇肆意妄为，便联合在这一带结寨杀贼，让流寇们吃了亏，不敢与山贼们硬碰硬。毕竟后方，还有大批明军追兵，所以流寇们便向西，进入湖广承宣布政使司黄州府麻城县内避难。2月10日，部分还在南直隶的流寇们，攻陷了安庆府潜山县，在转入湖广承宣布政使司黄州府罗田县。同时明山西总镇总兵：曹文诏，正在河南承宣布政使司围剿开封府陈州、许州，等地流寇，而湖广承宣布政使司的流寇们依旧还未逃出南直隶，还在攻打安庆府太湖县。以至于中原流寇们迫于诸路明军的收缩合力围剿，不得不从南阳府南下。又在明唐亲王：朱聿键，出钱粮的情况下，使得明军士气高涨，逼迫流寇从湖广承宣布政使司德安府应城县，转移阵地进驻到襄阳府枣阳县内。在汝宁府的流寇们，则南下也进入了湖广承宣布政使司黄州府。