别所长治得知上杉军丹波势接连攻落邻近播磨、摄津两国境目地带的荒木家治下城池兵砦后，他也只能这样眼睁睁看着。 因为别所长治之叔别所重栋已经被上杉将军家调略，在他的暗中阻挠下，别所家原先准备用于支援荒木家、石山本愿寺的粮草全被掉包成了砂石。 在东窗事发之后，别所重栋就直接放弃领地、居城，带着自己的家眷以及部分马廻众逃往丹波，寻求上杉将军家的庇护。 这就导致别所家上下人心惶惶不可终日，哪里还有余力去支援处在风雨飘摇之中的荒木家呢？ 不仅如此，八条景定在接纳别所重栋之后，还让其负责暗中调略别所家重臣、旗下国人领主，迫使别所家在短时间内无法对荒木家进行任何实质上的支援，以及无法牵制上杉军对荒木家的攻势。 而这时的荒木村重为了避免被上杉军东西两面夹击，只好让其子荒木村次率两千余军势镇守加茂城，自己则是节制池田知正、中川清秀、高山友照、荒木元清、荒木重坚、有间出羽守、十河越中守、十河左马允、三木五郎大夫、那须久右卫门、冈飞驒守、狛治部大辅、山口古市等摄津诸将以及先前招揽的三好家、松永家旧臣，率八千五百余军势东进至茨木城外，途中还与下间赖资所率的两万余一向一揆军合流，意图与上杉军进行决战。 可景定却下令紧闭城门，拒不出战。 以上杉景信、和田惟长、三好康长等人为首的上杉军诸将则是纷纷向景定请命，要求率军出战，一雪前耻。 但景定却对他们说：“我军前不久于石山御坊外受挫，损兵折将，如今好不容易才收拢了败军并恢复了一些士气，岂能仓促与敌军交战？如今敌军兵力雄厚、士气高涨，恃胜而骄，已有轻我之心，所以我军更应该坚守城池、以逸待劳，等到其军心骄躁，而我军士气振奋之际，必然能一战击败敌军，并趁势静谧摄州一州之地。之后敢言战者，余绝不轻饶！”
于是，两军就这样在茨木城一带对峙了整整一个月之久。 在此期间，景定还派遣本庄繁长率右龙骑军两千军势，以有马丰氏为向导，频繁对荒木·一向一揆联军的粮道、小荷驮队进行袭击，并接连焚毁粮车五十余辆。 荒木村重、下间赖资二人自然不能对上杉军袭击己方粮道和小荷驮队之事坐视不管，立即派那须久右卫门、冈飞驒守、十河因幡守、常乐寺证贤、下间大进等人率五千余军势主动出击，意图将本庄繁长、有马丰氏二人所部包围并歼灭。 不过，本庄繁长、有马丰氏二人却并不打算与荒木·一向一揆联军正面交锋，便在与荒木·一向一揆联军的交战中假装败退，并在沿途设下埋伏，大破荒木·一向一揆联军。 那须久右卫门、冈飞驒守、十河因幡守等人皆在混战之中被上杉军所讨取，常乐寺证贤、下间大进等人更是仅以身免。荒木·一向一揆联军被讨取、失踪者多达一千余人。 之后，本庄繁长、有马丰氏二人还挟大胜之余乘势攻下荒木家治下的安威城、丰中城、佐保城等地，甚至一度兵临池田城下，还烧毁了一部分城下町后才返回茨木城中。 虽说荒木·一向一揆联军损兵折将，实力受损，但其兵势却依旧不减。 永禄十二年，九月。 这时，荒木·一向一揆联军中的粮草辎重也所剩无几了，荒木家重臣荒木元清、荒木重兼等人本就不愿追随荒木村重与上杉将军家刀兵相见，便纷纷率部主动向上杉军投降。 此时的景定就觉得荒木·一向一揆联军已经上下离心，就下令由三好康长率五百余军势前去进驻三宅原，引诱荒木村重、下间赖资等人主动出战。 荒木村重、下间赖资二人见上杉军一部出城在三宅原安营扎寨后感到非常高兴，立即派中西新八郎、星野左卫门、宮脇又兵衛、隐岐土佐守、山脇勘左卫门等人率三千余军势向三好康长的营地发起猛烈进攻。 三好康长则是按照景定事先的部署，固守不出，坚守待援。就算是营地中断水数日，三好康长所部一连几天都滴水未进，可还是凭借两百余挺铁炮的火力压制，顽强击退了荒木军一次比一次更猛烈的进攻。 景定见荒木·一向一揆联军已是强弩之末，遂下达了总攻命令，上杉军立刻从茨木城、水尾城、芥川山城等地倾巢而出。 荒木村重、下间赖资二人匆忙召围攻三宅原上杉军营地的己方军势回军。 很快，两军就在吹田原一带展开了决战。 在混战中，景定派遣本庄繁长、石堂一彻、有马丰氏、沼田祐光等将率五百余名骑马武士率先冲击荒木·一向一揆联军本阵，其余上杉军各部紧随其后，向荒木·一向一揆联军发起猛攻。 上杉军在接连讨取荒木·一向一揆联军武士、僧兵、足轻、农兵、浪人等两千余人后，荒木·一向一揆联军开始力不能支，尤其是一向一揆军，这些乌合之众直接四散而逃，反而冲散了荒木军的阵型。 于是，景定就看准时机，下令上杉景信、和田惟长两部向荒木·一向一揆联军发起致命一击。 中西新八郎、星野左卫门、宮脇又兵衛、隐岐土佐守、山脇勘左卫门等荒木家家臣见势不妙，为了保住自己的小命，他们就不管自己的主君荒木村重的死活，直接放弃抵抗，率部向上杉军投降了。 而这些荒木家家臣的投降对荒木·一向一揆联军来说是致命的，这就导致兵力本就不占大头的荒木军也随之崩溃。 荒木村重在中川清秀、高山友照等家中重臣的护卫下，仅率一百余人逃回加茂城。而荒木·一向一揆联军经此一役阵亡者多达一万两千余人，伏尸达十余里。 作为石山本愿寺高级坊官的下间赖资也在逃回石山御坊的途中遭遇落武者狩，其首级被南摄津的领民以二十贯文的价格卖给了上杉军。 至于在逃跑途中被俘的常乐寺证贤、下间大进等人，景定则是没有对他们痛下杀手，反而大度的放他们返回石山御坊，让他们去劝说本愿寺显如尽快放弃抵抗，开城投降。 但同样被俘的三好家旧臣出身的十河越中守、十河左马允、三木五郎大夫等人就没有那么好的运气了，这些人反而被景定下令，通通押至京都六条河畔附近斩首示众。