第三案，移宫案。 王恭厂大爆炸。泰昌帝朱常洛驾崩之前生过七个儿子，但是只活下来了两个，一个叫朱由校，是后来的天启帝；一个叫朱由检，后来的崇祯帝。古代婴儿夭折率的确很高，但不至于七个只能活两个，更何况皇室子孙的生活条件应该更加优越，存活率更高才对。这时就要讲一下后宫的状况了：此时疑似杀人凶手的郑贵妃还活着（毕竟要不是万历死的早，她就成皇后了，那么高的地位，没人敢动她）；而朱常洛有一个宠妃姓李，被封为李康妃，由于朱常洛还有一个妃子姓李，为了区分，大家就叫李康妃为“西李”，而叫另一个姓李的妃子为“东李”，也就是李庄妃。西李可不是什么好角色，仗着自己受宠，经常欺负其他妃子，甚至亲手把朱由校的母亲王才人活活打死，王才人临终前遗言：“我与西李有仇，负恨难伸。”
事后，西李竟然未受到任何处罚，反而获得了抚养失去母亲的朱由校的资格。在朱常洛即位后，还和郑贵妃相互勾结，商业互吹，郑贵妃请封西李为皇后，西李则请封郑贵妃为皇太后，整天在朱常洛耳边说。当时朱常洛还生着病，病中也得不到休息，没办法，就召集群臣封西李为皇贵妃。但西李一听不是皇后，就生气了，她对朱由校说：“告诉你父皇，我要当皇后！”
（按规矩，议政之时，后宫之人不得抛头露面。）朱由校当时还小，没有能力反抗西李，只能走到群臣面前，提出西李的要求。群臣大多面面相觑，都不知道该怎么办。朱常洛很无奈，只能装作没听见。这时，救命稻草来了，礼部侍郎孙如游上奏说：“太后、元妃等人的谥号还没有定下来，把这些事情都解决以后再封皇贵妃也不迟。”
巧妙地将西李封皇后这件事拖了下来。朱常洛在心中点了个赞。结果，朱常洛一个月不到就驾崩了，成了中国乃至世界历史上在位时间最短的皇帝之一，而西李不仅没得到皇后的位置，还把皇贵妃的位置丢了，哭的那叫一个惨呐，不知道的还以为她和朱常洛感情有多深呢。这时，郑贵妃提醒她：“你还有一张王牌——朱由校在你手里。”
西李悟了，于是她赖在乾清宫（明朝皇帝的法定住所）中不走，又与千古大奸臣魏忠贤合谋把朱由校留在自己的身边，要求群臣给她册封，还要求朝廷的奏章全都要先由她过目再送到朱由校手里。群臣什么时候受过这种窝囊气——一个没册封的选侍（西李此时还只是选侍）竟然敢霸占乾清宫，扣押皇帝，还敢干涉内政，威胁群臣！到底是你当皇帝还是朱由校当皇帝？！于是东林党人大学士刘一燝、吏部尚书周嘉谟、兵科都给事中杨涟、御史左光斗等纷纷上书斥责西李。左光斗最为激烈，他表示：“这乾清宫只有皇帝皇后才有资格入住，你算什么东西，敢赖这里不走？你既不是先帝的皇后，又不是皇上的生母，鸠占鹊巢还敢扣押皇上？皇上都16岁，还需要你抱在怀里喂奶吗？更何况这个年纪正容易性冲动……难不成……你想像武则天一样又勾引现在的皇上吗？”
西李气疯了，当即表示：“你进宫，我要和你聊人生！”
左光斗知道进宫准没好事，就说：“我是御史，要是皇上叫我我就去，你算什么东西？”
西李没办法，说又说不过他，打又打不到他。后来群臣站在乾清宫门口和西李“和善的交流”着。门内的人尖叫着大喊：“大臣要逼宫啦！”
门外的人愤怒的大叫：“后宫要篡位啦！”
西李左右为难，她想了很久，只能灰溜溜的带着她女儿仓促离开乾清宫，移居到自己该去的地方——前朝妃嫔养老的哕鸾宫仁寿殿去了。最终，朱由校在奉天门成功登基，改年号为天启，史称天启帝。而天启帝由于被西李抚养长大而产生了一种厌世的情绪：毕竟抚养自己长大的人是自己的杀母仇人，这任谁都受不了。为了逃避现实，他喜欢上了做木工。后来的历史说明了他是一个技艺高超的绝世工匠，但他绝对不是一个好皇帝。可笑的是，命运决定了他只能当皇帝，而不能去做工匠。王座上的人生来就没得选。欲戴皇冠，必承其重，而其人既戴其冠，若无所需之力，则朝必崩，世必下。而他不管朝廷政治，也不看重后宫的妃子，专心于钻研木工，与他的父亲朱常洛形成了鲜明的对比。在这种背景下，大奸臣太监魏忠贤登场了。他把持朝政大权，时人称之为“九千岁九百岁”，与“万岁”爷只有一步之遥，很多人“只知有忠贤，而不知有皇上”。后宫也不得安宁，魏忠贤与朱由校的奶妈客氏相勾结，又将自己的义女送到后宫，使之被封为任贵妃。然后清除任贵妃生下太子的一切障碍——比如说张皇后怀孕的时候腰疼，客氏担心张皇后会生下嫡子，所以安排人去给张皇后做按摩时，让宫女“重手捶打”，结果张皇后生下了一个死胎，而且自此丧失了生育能力；而张裕妃怀孕以后，客氏和魏忠贤直接假传圣旨，将张裕妃关在冷宫里面，不提供任何食物、最终，张裕妃被饿死在了冷宫里；李成妃冒犯了客氏，有了张裕妃的前车之鉴，她提前在冷宫准备了食物，果然她也被客氏关到冷宫半个月，当客氏准备给她收尸时才发现她还活着，以为有神明保佑她，这才不敢继续加害她。除此之外，还有范慧妃、赵选侍、冯贵人、胡贵人等多名妃嫔，遭到魏忠贤和客氏的迫害，不是被囚禁，就是死。甚至有野史称后来朱由校身体虚弱之时，魏忠贤安排怀孕的女子入宫，伪造成怀着朱由校孩子的假象，这件事被张皇后发现才没有继续下去。而任皇妃生下儿子朱慈炅不久，发生了一场大爆炸，名为王恭厂大爆炸。这爆炸很奇怪，史书记载很多人的衣服一瞬间消失，大街上满是赤裸的男女；有的人头被炸飞了，身体却毫发无伤；天空中一直往下掉尸体，而这些尸体大多数浑身赤裸……传说爆炸前曾采集过含有铀的矿石，爆炸又产生了蘑菇云，爆炸过后又有瘟疫——大家全身溃烂（类似核辐射过量导致的人体损伤），因此有人认为这是核爆炸实验；又有传说爆炸前有红球从天而降，因此又有人认为是陨石坠落造成的；较真实一点的解释是：处在爆炸中心的王恭厂是一个火药库，火药因不明原因爆炸而造成的这场大爆炸。这场大爆炸发生时，天启帝正在吃早餐，他听到巨响时立刻注意到房梁断裂了。他作为一个木匠，非常了解房梁的作用，于是他把饭碗一扔，拔腿就跑，贴身护卫们想保护他，结果悲哀的发现皇上跑的太快了，根本追不上。只有一个护卫勉强追上，结果这个护卫被掉落的瓦片砸死了。而皇上跑进交泰殿，躲在桌子底下，逃过了一劫。而不到一岁的朱慈炅则被这场大爆炸吓死了。朱由校也就没有儿子了。群臣议论纷纷，觉得是皇帝不问朝政引发了天灾，这件事之后也被用作党争的工具，不过这是后话了。